| Issue Date | Title | Author(s) |
| 2015 | BINDING MECHANISM OF CALCIUM AND SODIUM ION OF CavAb CHANNEL | Baştuğ, Turgut ; Çavuş, Murat; Kuyucak, Serdar |
| 2007 | Binding of Organic Cations To Gramicidin a Channel Studied With Autodock and Molecular Dynamics Simulations | Patra, S. M.; Baştuğ, T. ; Kuyucak, S. |
| 2011 | Comparative Study of the Energetics of Ion Permeation in Kv1.2 and Kcsa Potassium Channels | Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar |
| 2017 | Energetics of Ion Conduction in the Navms Channel | Körpe, E.; Acar, A. O.; Çavuş, M.; Kuyucak, S.; Baştuğ, T. |
| 2011 | Free Energy Simulations of Ligand Binding To the Aspartate Transporter Glt(ph) | Heinzelmann, Germano; Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar |
| 2009 | Importance of the Peptide Backbone Description in Modeling the Selectivity Filter in Potassium Channels | Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar |
| 2013 | Interaction of Adwx-1 and Coba1 Toxins With Kv1.1 Potassium Channel by Using Docking and Md Methods | Biçen, M.; Baştuğ, T. |
| 2018 | İlaç Adayları için Charmm Uyumlu Kuvvet Alanı Geliştirme | Gürsoy, Emre |
| 2016 | Karbonik Anhidraz İnhibitöru? Kumarin Bileşiklerinin Etki Mekanizmalarının Moleku?ler Modelleme Teknikleri ile Araştırılması ve Biyolojik Etkisi Yu?ksek Yeni Kumarin Tu?revlerinin Tasarımı | Eroğlu, Erol; Baştuğ, Turgut ; Türkmen, Hasan; Nacar, Mehmet Akif; Tekpınar, Mustafa |
| 2017 | Mechanism and Energetics of Ion and Tetrodotoxin Binding To Navms Channel | Körpe, Esra; Acar, Ali Osman; Çavuş, Murat; Kuyucak, Serdar; Baştuğ, Turgut |
| 2013 | Mechanism and Energetics of Ligand Release in the Aspartate Transporter Glt(ph) | Heinzelmann, Germano; Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar |
| 2017 | Memelilerde Bulunan Sodyum Kanallarının Homoloji Modellemesi ve Doğruluğunun Test Edilmesi | Acar, Ali Osman |
| 2015 | Molecular Dynamics Investigation of Alphaconotoxin Si Binding To Nachr | Tuna, Onur; Baştuğ, Turgut |
| 2017 | Molecular Modeling of Mammalian Na(v)1.4 Channel | Acar, Ali Osman; Körpe, Esra; Çavuş, Murat; Kuyucak, Serdar; Baştuğ, Turgut |
| 2014 | Moleküler Modelleme Yöntemleri ile Toksin Peptitlerinden İlaç Tasarımı | Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar; Biçen, Merve; Tuna, Onur |
| 2016 | Paralysis Mechanism of A-Conotoxin Si From Molecular Dynamics Simulations and Free Energy Calculations | Tuna, O.; Kuyucak, S.; Baştuğ, T. |
| 2012 | Position of the Third Na+ Site in the Aspartate Transporter Glt(ph) and the Human Glutamate Transporter, Eaat1 | Baştuğ, Turgut ; Heinzelmann, Germano; Kuyucak, Serdar; Salim, Marietta; Vandenberg, Robert J.; Ryan, Renae M. |
| 2008 | Potential of Mean Force Calculations of Ligand Binding To Ion Channels From Jarzynski's Equality and Umbrella Sampling | Baştuğ, Turgut ; Chen, Po-Chia; Patra, Swarna M.; Kuyucak, Serdar |
| 2014 | Protein-peptid Sistemlerinin Moleküler Dinamik Simülasyonları ve Serbest Enerji Hesapları: Nöromüsküler Nikotinik Asetilkolin Reseptörüne ?-konotoksin Sı Bağlanma Mekanizması | Tuna, Onur |
| 2008 | Response To "comment on 'free Energy Simulations of Single and Double Ion Occupancy in Gramicidin A' " [j. Chem. Phys. 128, 227101 (2008)] | Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar |
| 2015 | SODYUM KANALINDA İYON TRANSFERİNİN ENERJİSİ | Çavuş, Murat; Baştuğ, Turgut ; Kuyucak, Serdar |
| 2017 | Sodyum Kanallarında İyon Taşınımının ve Toksin Bağlanmasının Moleküler Modellemesi | Körpe, Esra |
